Перебирая содержимое файла в Bash - PullRequest
1151 голосов
/ 05 октября 2009

Как перебрать каждую строку текстового файла с помощью Bash ?

С помощью этого скрипта:

echo "Start!"
for p in (peptides.txt)
do
    echo "${p}"
done

Я получаю этот вывод на экране:

Start!
./runPep.sh: line 3: syntax error near unexpected token `('
./runPep.sh: line 3: `for p in (peptides.txt)'

(Позже я хочу сделать что-то более сложное с $p, чем просто вывод на экран.)


Переменная окружения SHELL (из env):

SHELL=/bin/bash

/bin/bash --version выход:

GNU bash, version 3.1.17(1)-release (x86_64-suse-linux-gnu)
Copyright (C) 2005 Free Software Foundation, Inc.

cat /proc/version вывод:

Linux version 2.6.18.2-34-default (geeko@buildhost) (gcc version 4.1.2 20061115 (prerelease) (SUSE Linux)) #1 SMP Mon Nov 27 11:46:27 UTC 2006

Файл peptides.txt содержит:

RKEKNVQ
IPKKLLQK
QYFHQLEKMNVK
IPKKLLQK
GDLSTALEVAIDCYEK
QYFHQLEKMNVKIPENIYR
RKEKNVQ
VLAKHGKLQDAIN
ILGFMK
LEDVALQILL

Ответы [ 11 ]

0 голосов
/ 30 августа 2015

@ Питер: Это может сработать для вас ...

echo "Start!";for p in $(cat ./pep); do
echo $p
done

Это вернет результат-

Start!
RKEKNVQ
IPKKLLQK
QYFHQLEKMNVK
IPKKLLQK
GDLSTALEVAIDCYEK
QYFHQLEKMNVKIPENIYR
RKEKNVQ
VLAKHGKLQDAIN
ILGFMK
LEDVALQILL
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...