Мне удалось взломать это вместе с линейным индексированием ... это дает правильный результат, но работает довольно медленно на больших массивах.
A = np.array([[4, 0, 0],
[1, 2, 3],
[0, 0, 5]]).astype(float)
r = np.array([2, 0, -1])
rows, column_indices = np.ogrid[:A.shape[0], :A.shape[1]]
# Use always a negative shift, so that column_indices are valid.
# (could also use module operation)
r_old = r.copy()
r[r < 0] += A.shape[1]
column_indices = column_indices - r[:,np.newaxis]
result = A[rows, column_indices]
# replace with NaNs
row_length = result.shape[-1]
pad_inds = []
for ind,i in np.enumerate(r_old):
if i > 0:
inds2pad = [np.ravel_multi_index((ind,) + (j,),result.shape) for j in range(i)]
pad_inds.extend(inds2pad)
if i < 0:
inds2pad = [np.ravel_multi_index((ind,) + (j,),result.shape) for j in range(row_length+i,row_length)]
pad_inds.extend(inds2pad)
result.ravel()[pad_inds] = nan
Дает ожидаемый результат:
print result
[[ nan nan 4.]
[ 1. 2. 3.]
[ 0. 5. nan]]