pd.read_hdf throws 'не может установить флаг WRITABLE в True для этого массива'

Question

при работе

pd.read_hdf('myfile.h5')

Я получаю следующую ошибку трассировки:

[[... немного больше трассировки]]

~ / .local / lib / python3.6 / site-packages / pandas / io / pytables.py в read_array (self, key, start, stop) 2487 2488, если isinstance (node, tables.VLArray): -> 2489 ret = node [0] [start: stop] 2490 else: 2491 dtype = getattr (attrs, 'value_type', None)

~ / .local / lib / python3.6 / site-packages / tables / vlarray.py в getitem (self, key)

~ / .local / lib / python3.6 / site-packages / tables / vlarray.py в режиме чтения (самостоятельно, начало, остановка, шаг)

tables / hdf5extension.pyx в tables.hdf5extension.VLArray._read_array ()

ValueError: невозможно установить для флага WRITEABLE значение True этого массива

Понятия не имею, что происходит. Я попытался переустановить tables, pandas все в принципе, но не хочет читать.

Answer 1

Кажется, что time-date строки вызывали проблему, и когда я преобразовал их из текста в numpy (pd.to_datetime()) и сохранил таблицу, и проблема исчезла, так что, возможно, она как-то связана с текстовыми данными?

Answer 2

Вы используете numpy 1.16? Он несовместим с последним выпуском pytables (см. https://github.com/PyTables/PyTables/blob/v3.4.4/tables/hdf5extension.pyx#L2155), но команда pytables еще не выпустила исправленную версию: https://github.com/PyTables/PyTables/issues/719

Единственный способ, который я нашел, чтобы это исправить, - понизить рейтинг NumPy.