Воспроизведение среды conda, когда пакеты больше не доступны из каналов

Question

Я хотел бы опубликовать среду conda, используемую для анализа данных, лежащую в основе научной статьи. Я сохранил среду в файл .yml, используя conda env export > environment.yml

Мне удалось некоторое время заново создать ту же среду на другом компьютере, используя conda env create -f environment.yml. Через пару месяцев создание среды из того же файла .yml завершается неудачно:

ResolvePackageNotFound: - vc=14.1=h0510ff6_3 - vs2015_runtime=15.5.2=3

Предположительно, эти версии больше не доступны на каналах, указанных в файле? Или это может отражать другую проблему?

Возможно, точные версии не имеют особого значения в моем конкретном случае, но эта проблема, кажется, в первую очередь побеждает цель сохранения окружающей среды. Есть ли другая команда или стратегия для сохранения среды таким образом, чтобы она была более ориентирована на будущее?

Я пытаюсь установить среду с помощью миниконды.

Конда версия 4.5.4

Python версия: 3.6.5.final.0

Вот полный файл .yml:

    name: jlsocial
channels:
  - conda-forge
  - defaults
dependencies:
  - ca-certificates=2018.4.16=0
  - certifi=2018.4.16=py36_0
  - libiconv=1.15=hfa6e2cd_1
  - libxml2=2.9.8=haffccfe_2
  - libxslt=1.1.32=h5632236_1
  - lxml=4.2.3=py36heafd4d3_0
  - openssl=1.0.2o=hfa6e2cd_1
  - svglib=0.8.1=py36_0
  - svgutils=0.3.0=py36_0
  - backcall=0.1.0=py36_0
  - blas=1.0=mkl
  - bleach=2.1.3=py36_0
  - blosc=1.14.3=he51fdeb_0
  - bokeh=0.12.16=py36_0
  - bzip2=1.0.6=hfa6e2cd_5
  - click=6.7=py36hec8c647_0
  - cloudpickle=0.5.3=py36_0
  - colorama=0.3.9=py36h029ae33_0
  - cycler=0.10.0=py36h009560c_0
  - cytoolz=0.9.0.1=py36hfa6e2cd_0
  - dask=0.17.5=py36_0
  - dask-core=0.17.5=py36_0
  - decorator=4.3.0=py36_0
  - distributed=1.21.8=py36_0
  - entrypoints=0.2.3=py36hfd66bb0_2
  - freetype=2.8=h51f8f2c_1
  - hdf5=1.10.2=hac2f561_1
  - heapdict=1.0.0=py36_2
  - html5lib=1.0.1=py36h047fa9f_0
  - icc_rt=2017.0.4=h97af966_0
  - icu=58.2=ha66f8fd_1
  - imageio=2.3.0=py36_0
  - intel-openmp=2018.0.0=8
  - ipykernel=4.8.2=py36_0
  - ipython=6.4.0=py36_0
  - ipython_genutils=0.2.0=py36h3c5d0ee_0
  - ipywidgets=7.2.1=py36_0
  - jedi=0.12.0=py36_1
  - jinja2=2.10=py36h292fed1_0
  - jpeg=9b=hb83a4c4_2
  - jsonschema=2.6.0=py36h7636477_0
  - jupyter=1.0.0=py36_4
  - jupyter_client=5.2.3=py36_0
  - jupyter_console=5.2.0=py36h6d89b47_1
  - jupyter_core=4.4.0=py36h56e9d50_0
  - kiwisolver=1.0.1=py36h12c3424_0
  - libpng=1.6.34=h79bbb47_0
  - libsodium=1.0.16=h9d3ae62_0
  - libtiff=4.0.9=hb8ad9f9_1
  - locket=0.2.0=py36hfed976d_1
  - lzo=2.10=h6df0209_2
  - m2w64-gcc-libgfortran=5.3.0=6
  - m2w64-gcc-libs=5.3.0=7
  - m2w64-gcc-libs-core=5.3.0=7
  - m2w64-gmp=6.1.0=2
  - m2w64-libwinpthread-git=5.0.0.4634.697f757=2
  - markupsafe=1.0=py36h0e26971_1
  - matplotlib=2.2.2=py36h153e9ff_1
  - mistune=0.8.3=py36hfa6e2cd_1
  - mkl=2018.0.2=1
  - mkl_fft=1.0.1=py36h452e1ab_0
  - mkl_random=1.0.1=py36h9258bd6_0
  - msgpack-python=0.5.6=py36he980bc4_0
  - msys2-conda-epoch=20160418=1
  - nbconvert=5.3.1=py36h8dc0fde_0
  - nbformat=4.4.0=py36h3a5bc1b_0
  - networkx=2.1=py36_0
  - notebook=5.5.0=py36_0
  - numexpr=2.6.5=py36hcd2f87e_0
  - numpy=1.14.3=py36h9fa60d3_1
  - numpy-base=1.14.3=py36h555522e_1
  - olefile=0.45.1=py36_0
  - opencv=3.3.1=py36h20b85fd_1
  - packaging=17.1=py36_0
  - pandas=0.23.0=py36h830ac7b_0
  - pandoc=1.19.2.1=hb2460c7_1
  - pandocfilters=1.4.2=py36h3ef6317_1
  - parso=0.2.0=py36_0
  - partd=0.3.8=py36hc8e763b_0
  - patsy=0.5.0=py36_0
  - pickleshare=0.7.4=py36h9de030f_0
  - pillow=5.1.0=py36h0738816_0
  - pip=10.0.1=py36_0
  - prompt_toolkit=1.0.15=py36h60b8f86_0
  - psutil=5.4.5=py36hfa6e2cd_0
  - pygments=2.2.0=py36hb010967_0
  - pyparsing=2.2.0=py36h785a196_1
  - pyqt=5.9.2=py36h1aa27d4_0
  - pytables=3.4.3=py36he6f6034_1
  - python=3.6.5=h0c2934d_0
  - python-dateutil=2.7.3=py36_0
  - pytz=2018.4=py36_0
  - pywavelets=0.5.2=py36hc649158_0
  - pywinpty=0.5.1=py36_0
  - pyyaml=3.12=py36h1d1928f_1
  - pyzmq=17.0.0=py36hfa6e2cd_1
  - qt=5.9.5=vc14he4a7d60_0
  - qtconsole=4.3.1=py36h99a29a9_0
  - reportlab=3.4.0=py36_0
  - scikit-image=0.13.1=py36hfa6e2cd_1
  - scikit-learn=0.19.1=py36h53aea1b_0
  - scipy=1.1.0=py36h672f292_0
  - seaborn=0.8.1=py36h9b69545_0
  - send2trash=1.5.0=py36_0
  - setuptools=39.1.0=py36_0
  - simplegeneric=0.8.1=py36_2
  - sip=4.19.8=py36h6538335_0
  - six=1.11.0=py36h4db2310_1
  - snappy=1.1.7=h777316e_3
  - sortedcontainers=1.5.10=py36_0
  - sqlite=3.23.1=h35aae40_0
  - statsmodels=0.9.0=py36h452e1ab_0
  - tblib=1.3.2=py36h30f5020_0
  - terminado=0.8.1=py36_1
  - testpath=0.3.1=py36h2698cfe_0
  - tk=8.6.7=hcb92d03_3
  - toolz=0.9.0=py36_0
  - tornado=5.0.2=py36_0
  - traitlets=4.3.2=py36h096827d_0
  - vc=14.1=h0510ff6_3
  - vs2015_runtime=15.5.2=3
  - wcwidth=0.1.7=py36h3d5aa90_0
  - webencodings=0.5.1=py36h67c50ae_1
  - wheel=0.31.1=py36_0
  - widgetsnbextension=3.2.1=py36_0
  - wincertstore=0.2=py36h7fe50ca_0
  - winpty=0.4.3=4
  - wxpython=4.0.1=py36h4cd245c_0
  - yaml=0.1.7=hc54c509_2
  - zeromq=4.2.5=hc6251cf_0
  - zict=0.1.3=py36h2d8e73e_0
  - zlib=1.2.11=h8395fce_2
  - pip:
    - tables==3.4.3
prefix: C:\Users\jlarsch\AppData\Local\Continuum\miniconda3\envs\jlsocial

Answer 1

Всем, кто заинтересован, причина этой проблемы устранена и закрыта континуумом в: https://github.com/conda/conda/issues/7714 И далее обсуждается в: https://github.com/ContinuumIO/anaconda-issues/issues/10004.

Но вкратце, эти два пакета были "отозваны", и логика нового пакета решения (для anaconda python 3.7) плохо справляется с этим сценарием.

Возможное решение скопировано с https://github.com/conda/conda/issues/7714:

Действия по исправлению вашей среды, если вы в данный момент не работаете:

1. Обратите внимание на местоположение вашей текущей среды conda. Для примера, скажем, это на C:\Users\ScoobyDoo\Anaconda3. Вам также нужно знать версию Python, которая была у вас до того, как вы столкнулись с этими ошибками. Допустим, для этого примера это Python 3.5.
2. Загрузка миниконды с https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Windows-x86_64.exe. (Вы можете использовать Miniconda3 или Miniconda2; это не имеет значения.)
3. Запустите установщик miniconda, выберите «Установить» для «Просто я», а затем укажите папку назначения, которая отличается от текущей базовой среды. Для этого примера мы поместим его в C:\temp-conda.
4. В любой командной строке введите команду C:\temp-conda\Scripts\conda.exe install -p C:\Users\ScoobyDoo\Anaconda3 python=3.5 conda
5. Ваша обычная конда теперь должна быть исцелена, и теперь вы можете удалить каталог C:\temp-conda, если хотите.
6. Когда вы запустили новый установщик miniconda, ярлык «Anaconda Prompt» мог быть изменен. Если он больше не работает правильно, щелкните правой кнопкой мыши значок «Anaconda Prompt», выберите «Свойства» и установите для поля Target значение C:\Users\ScoobyDoo\Anaconda3 вместо C:\temp-conda. Обратите внимание, что вам может потребоваться внести два изменения в поле Target вместо одного. Так как поле поля довольно маленькое, обычно легче выбрать поле, нажать Ctrl-A, затем Ctrl-C (чтобы выделить весь текст, затем скопировать), вставить текст в пустой файл блокнота, внести изменения, а затем скопировать и вставьте отредактированный текст обратно в поле Target.

Answer 2

У меня была почти точно такая же проблема только сегодня. Основываясь на других SO post , я переместил два пакета с проблемами в раздел pip моего файла .yml. i.e.:

  -pip:
    - vc==14.1=h0510ff6_3
    - vs2015_runtime==15.5.2=3

Это, казалось, решило проблему для меня, хотя я не уверен, что это обязательно лучший способ.

РЕДАКТИРОВАТЬ: При ближайшем рассмотрении я понимаю, что это не решило проблему. Вместо этого я переместил два пакета обратно в зависимости и просто удалил требования к версии (вместо этого он выбрал более старую версию vc). i.e.:

dependencies:
  - vc
  - vs2015_runtime

Полученные версии были:

vc                        14                   h0510ff6_3
vs2015_runtime            14.0.25123                    3

У меня одинаковые настройки на обоих компьютерах, поэтому, почему это произошло, я не совсем уверен.