ок, нашел решение
Таким образом, по умолчанию libsqlite3 не установлен в Docker, это можно проверить с помощью команды:
RUN ldd lib/src/libdart_sqlite.so
Решение:
FROM google/dart-runtime
USER root
RUN apt-get -y update
RUN apt-get -y upgrade
RUN apt-get install -y sqlite3 libsqlite3-dev