Составьте таблицу и сохраните там номер вашей версии. Просто убедитесь, что вы обновляете его по мере необходимости.
CREATE TABLE version (
version VARCHAR(255) NOT NULL
)
INSERT INTO version VALUES ('v1.0');
Затем вы можете проверить, что номер версии, хранящийся в базе данных, соответствует коду приложения во время установки вашего приложения или там, где это удобно.