вы можете попробовать это, чтобы удалить шаблон напрямую.Зачем добавлять сложность, сначала выполняя поиск, а затем удаляя?
mylist = []
for i in f:
# you can use readline() function here
mylist.append(i.strip().split('\t')) #removing newlines '\n'
my_new_list = [mystr.replace("@@",'') for mystr in mylist]
Вы также можете сделать это в одну строку следующим образом:
with open('your_file_path_here','r') as f:
print([mystr.replace("@@",'') for mystr in f.readlines()])