Если вы хотите сделать это на стороне клиента, вы можете использовать библиотеку, такую как jQuery, для итераций по флажкам.
Если вы хотите сделать это на стороне сервера, вам нужно будет пересчитать элементы управления при обратной передаче и проверить значение Checked. В качестве альтернативы, если этот GridView связывается с источником данных, проверьте значения, отправленные обратно в источнике данных.