Сортировка ListA строк TSV по другому ListB, который содержит частичную строку из ListA

Question

У меня есть 2 списка: ListA, который содержит строки, разделенные табуляцией, и ListB, который содержит строки, которые частично соответствуют строкам в ListA.Я хотел бы упорядочить строки в ListA в том же порядке, что и в ListB, если частичные строки ListB соответствуют строкам в ListA.

. Я попытался выполнить циклListA, разделите каждую строку на \t, разделите 5-й столбец на _ и добавьте строку к временному ListC.Затем я заказал ListC, но я все еще не знаю, как я могу заказать фактические ListA, данные ListC.

ListA = ['rs141130360\tchr1:16495\tC\t653635\tNC_024540.1\tTranscript\tintron_variant,non_coding_transcript_variant\t-\t-\t-\t-\t-\trs3210724\tG\tMODIFIER\t-\t-1\t-\tSNV\tWASH7P\tEntrezGene\tHGNC:38034\ttranscribed_pseudogene\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\tRefSeq\tG\tG\tOK\t-\t-\t-\t-\t8/10\t-\t-\tNR_024540.1:n.1080+112C>G\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\n',
         'rs141130360\tchr1:16495\tC\t100287102\tNR_046018.2\tTranscript\tdownstream_gene_variant\t-\t-\t-\t-\t-\trs3210724\tG\tMODIFIER\t2086\t1\t-\tSNV\tDDX11L1\tEntrezGene\tHGNC:37102\ttranscribed_pseudogene\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\tRefSeq\tG\tG\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\n',
         'rs141130360\tchr1:16495\tC\t102466751\tNG_106918.1\tTranscript\tdownstream_gene_variant\t-\t-\t-\t-\t-\trs3210724\tG\tMODIFIER\t874\t-1\t-\tSNV\tMIR6859-1\tEntrezGene\tHGNC:50039\tmiRNA\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\tRefSeq\tG\tG\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\n']

ListB = ["NC", "NG", "NM", "NP", "NR", "XM", "XP", "XR", "WP"]
ListC = []


for i in ListA:
    i_split = i.split("\t")[4].split("_")[0]
    ListC.append(i_split)
ListC = sorted(ListC, key=lambda x: ListB.index(x))
print(ListC)    

напечатает:

['NC', 'NG', 'NR']

Myожидаемые результаты следующие:

['rs141130360\tchr1:16495\tC\t653635\tNC_024540.1\tTranscript\tintron_variant,non_coding_transcript_variant\t-\t-\t-\t-\t-\trs3210724\tG\tMODIFIER\t-\t-1\t-\tSNV\tWASH7P\tEntrezGene\tHGNC:38034\ttranscribed_pseudogene\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\tRefSeq\tG\tG\tOK\t-\t-\t-\t-\t8/10\t-\t-\tNR_024540.1:n.1080+112C>G\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\n',
'rs141130360\tchr1:16495\tC\t102466751\tNG_106918.1\tTranscript\tdownstream_gene_variant\t-\t-\t-\t-\t-\trs3210724\tG\tMODIFIER\t874\t-1\t-\tSNV\tMIR6859-1\tEntrezGene\tHGNC:50039\tmiRNA\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\tRefSeq\tG\tG\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\n', 
'rs141130360\tchr1:16495\tC\t100287102\tNR_046018.2\tTranscript\tdownstream_gene_variant\t-\t-\t-\t-\t-\trs3210724\tG\tMODIFIER\t2086\t1\t-\tSNV\tDDX11L1\tEntrezGene\tHGNC:37102\ttranscribed_pseudogene\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\tRefSeq\tG\tG\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\t-\n']

Answer 1

Я бы вместо этого преобразовал ListB в словарь [value, index], затем создал бы функцию, которая извлекает значение из строки и ищет его в dict.Это будет наша функция key для sorted.

d = {x: i for i, x in enumerate(ListB)}

def get_index(s):
    by_tabs = s.split('\t')
    by_underscore = by_tabs[4].split('_')
    return d[by_underscore[0]]

listC = sorted(ListA, key=get_index)