То есть компиляция страниц asp.Net на промежуточный язык + компиляция JIT - это происходит только при первой загрузке страницы. (См. http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms366723.aspx)
Если это действительно беспокоит вас, вы можете остановить это, предварительно скомпилировав свой сайт.
РЕДАКТИРОВАТЬ: Просто перечитайте вопрос - 60 секунд очень долго, и вы ожидаете увидеть некоторую активность процессора в течение этого времени. Проверьте EventLog для ошибок / сообщений в Системе и Приложениях назначения. Также попробуйте создать аварийный дамп процесса w3wp в течение этих 60 секунд - есть вероятность, что вы можете узнать, что он делает, взглянув на некоторые стеки вызовов.
Если для этого требуется точно 60 секунд каждый раз, то вполне вероятно, что ожидание чего-то истекает - 60 секунд - хорошее круглое число. Убедитесь, что он правильно подключен к контроллерам домена и т. Д. *
(Если есть некоторые средства диагностики IIS, которые могли бы работать лучше, то, боюсь, я не знаю о них, этот вопрос может быть более подходящим для ServerFault, приведенный выше подход гораздо более понятен устранение неполадок :-p)