Удалить нечетные строки (1,3,5, ..) -> :%s/\(.*\)\n\(.*\)\n/\2\r/g
Удалить четные строки (2,4,6, ..) -> :%s/\(.*\)\n.*\n/\1\r/g
Поиск текста (формирует первую строку), за которым следует символ новой строки и еще немного текста (формирует вторую строку), за которым следует другой символ новой строки, и замените вышеуказанное либо первым соответствием (нечетная строка), либо вторым соответствием ( четная линия) с последующим возвратом каретки.