Вы можете решить это за O (n) сложность
var arr = [1,3,54,56,6,6,1,6];
var obj = {};
/* first convert the array in to object with unique elements and number of times each element is repeated */
for(var i = 0; i < arr.length; i++)
{
var x = arr[i];
if(!obj[x])
obj[x] = 1;
else
obj[x]++;
}
console.log(obj);//just for reference
/* now traverse the object to get the element */
var index = 0;
var max = 0;
for(var obIndex in obj)
{
if(obj[obIndex] > max)
{
max = obj[obIndex];
index = obIndex;
}
}
console.log(index+" got maximum time repeated, with "+ max +" times" );
Просто скопируйте и вставьте в консоль Chrome, чтобы запустить приведенный выше код.