По умолчанию он будет храниться в C: \ Program Files (x86) \ Microsoft SQL Server \ 110 \ DTS \ Packages в SQL Server 2012.
В следующей версии, такой как 2008,2010,2012,2014, она будет находиться в папке 90 \ 100 \ 110 \ 120 по указанному выше пути.
Но опять же, если вы развертываете, местоположение пакета ssis зависит от типа развертывания.
В Файловой системе - Вы можете указать путь.