Если вы собираетесь расширить свою систему, сейчас самое время изменить ее, если это будет необходимо. Редизайн гораздо менее болезненный, если у вас есть 11 000 записей, чем когда у вас есть 10 миллионов. Тем не менее, ничего из того, что вы сказали, не указывает на то, что вам нужно изменить дизайн. Нет ничего плохого в том, чтобы иметь объединения (на самом деле они должны быть в хорошо спроектированной базе данных). Опубликуйте некоторые подробности о будущем, и мы поможем вам решить, требуется ли редизайн.
Возможно, проблема в том, что вы и ваши коллеги просто не имеете опыта доступа к базе данных и не знаете, как эффективно и легко запрашивать их. Или проблема может заключаться в том, что дизайн плох, без деталей структуры, трудно сказать.