Есть много решений этой проблемы. Но все они зависят от вашей ситуации с хостингом. Если вы не контролируете свой сервер, тогда ваш веб-сайт будет работать как есть.
Поместите индекс. html в папку root С файлом barebones HTML, который содержит мета-адрес
<meta http-equiv="refresh" content="0;url=/folder_that_has_homepage" />
Честно говоря, я бы, наверное, просто нашел и заменил, чтобы исправить ваши пути.