Полагаю, HTML-код, который вы показываете, находится внутри .node-form .taxonomy-super-select-checkboxes
, чем бы он ни был.
div.fieldset-wrapper и div # edit-taxonomy-tags-1-wrapper - это два разных div в вашем html, поэтому, если вы ожидаете одинакового вывода от обоих, один из них не будет делать то, что ожидалось. Но это не значит, что найти неправильно.
Вы предоставили селекторы для двух разных элементов