Слово в канале #mercurial IRC гласит, что подпункты будут продолжать работать так же, как и они, и поддержка будет расти. Например, в настоящее время команда «hg status» не знает о subrepo - она работает, она просто не повторяется, но это будет в будущем. Однако текущее поведение, файловые форматы (.hgsub и .hgsubstate) будут изменены только обратно совместимыми способами.
Итак, продолжайте и рассчитывайте на это сейчас, и с нетерпением ждем, пока это станет лучше.
P.S. Начиная с Mercurial 1.4.2, подзапросы теперь могут быть репозиториями Subversion, так что вы можете использовать родителя Mercurial и SVN Kid.