та же проблема.это была проблема с правами доступа.
exec от php:
'mysql --user=root --password=zxc db < /stuff.sql'
stuff.sql
LOAD DATA LOCAL INFILE '/stuff.csv' INTO TABLE `stuff` FIELDS TERMINATED BY ',' LINES TERMINATED BY '\n'
Ошибки с искаженными пакетами.
Решение:
chmod 777 /stuff.csv
PHP работает на своем собственном уровне разрешений, а mysql не получает доступа для чтения к stuff.csv
Вы получаетепеченье если ненавидишь chmod 777