Если javascript связывает обработку страницы более 10 секунд, вы получите это сообщение. IE, очевидно, имеет более медленный движок JavaScript, вызывая это.
Я предполагаю, что некоторая оптимизация кода, безусловно, поможет, и попытайтесь уменьшить количество JavaScript, выполняемых при загрузке страницы. Возможно, используйте setTimeout (), чтобы отложить обработку некоторых ненужных вещей, если это необходимо.
Что касается инструментов, используйте профилировщик Firebug, чтобы увидеть, на что вы тратите столько времени.