Если вы хотите журналы в отдельном файле, отличном от консоли:
Двойной щелчок по серверу -> Открыть конфигурацию запуска -> Аргументы -> Добавить
-Dlog.dir = "Путь, где вы хотите сохранить этот файл" и перезапустите сервер.
Совет. Убедитесь, что сервер не работает, когда вы пытаетесь добавить аргумент.
У вас должен быть log4j или аналогичный каркас регистрации.