Общий вопрос, без учета конкретного случая - обычно предпочитают использовать хранимые процедуры MySQL вместо написания PHP-скрипта, который выполняет те же вычисления и запросы?
Каковы преимущества каждого метода?
В любом случае, конечный пользователь получит выгоду от абстракции данных из пользовательского интерфейса.Поэтому вам следует максимально использовать хранимые процедуры.