Я обнаружил ту же проблему с Tomcat версии 6.026.
Я использовал Mysql JDBC.jar в библиотеке WebAPP, а также в TOMCAT Lib.
Чтобы исправить вышеперечисленное, удалив Jar из папки lib TOMCAT.
Итак, я понимаю, что TOMCAT правильно обрабатывает утечку памяти JDBC. Но если JAS-файл MYSQL дублируется в WebApp и Tomcat Lib, Tomcat сможет обрабатывать только банку, присутствующую в папке Tomcat Lib.