Используйте Пути поиска заголовка пользователя для путей, которые вы хотите найти #include "...", и используйте Пути поиска заголовка для #include <...>.Конечно, если вы отметите опцию Всегда искать пути пользователя , то #include <...> также будет работать для путей пользователя.