Date.now()-Math.floor(Date.now()/1000/60/60/24)*24*60*60*1000
Это должно дать вам миллисекунды с начала дня.
(Date.now()-Math.floor(Date.now()/1000/60/60/24)*24*60*60*1000)/1000
Это должно дать вам секунды.
(Date.now()-(Date.now()/1000/60/60/24|0)*24*60*60*1000)/1000
То же, что и предыдущий, за исключением использования побитового оператора для определения количества дней.