Если это означает, что вы устанавливаете несколько баз данных на нескольких серверах, то это один из рекомендуемых способов масштабирования. Если вы имеете в виду несколько таблиц на одном и том же сервере (в одной базе данных или нет), ваш выигрыш будет небольшим, если вообще будет; и ваши административные издержки, вероятно, увеличатся, чтобы синхронизировать их. И если во всех запросах, затрагивающих несколько таблиц, будут какие-либо случаи, они будут менее эффективными.
Эффект вряд ли будет значительным ни для добра, ни для зла. Какую выгоду вы ожидаете? (Кстати, это типичный антипаттерн rdbms для преждевременной оптимизации.)