Вы можете использовать diff
со следующим форматированием вывода:
diff --old-line-format='' --unchanged-line-format='' file1 file2
--old-line-format=''
, отключить вывод для файла1, если строка отличается, сравнить в файле2.
--unchanged-line-format=''
, отключить вывод, если строки были одинаковыми.