DOC-файлы хранятся в двоичном формате, в котором не было написанных чисто php-классов для работы с ними.
RTF-файлы гораздо проще анализировать, так как в основном это текст, вы можете просто открыть их с помощью fopen и прочитать содержимое.
Я бы посоветовал использовать RTF, если вы можете, поскольку на самом деле пока нет звукового решения для файлов DOC.