Посмотрите на valid_elements и extended_valid_elements.
EDIT:
Вы можете использовать закрытый параметр в вашем init-файле:
closed : /^(br|hr|input|meta|img|link|param|area)$/, // default
до
closed: /^(br|hr|input|meta|img|link|param|area|source)$/,
Если это не работает, то я думаю, что вам может понадобиться изменить одну строку кода из кода ядра tinymce, расположенного в Editor.js на строке 2666 (новейшая крошечная версия mce), и расширить его настройку с помощью тега source.