Вам нужно открыть командную строку от имени администратора в папке, где установлен ваш Mongo (в моем случае: C: \ Program Files \ MongoDB \ Server \ 3.4 \ bin).
Если вы хотите сбросить всю базу данных, вы можете просто использовать:
mongodump --db database_name
У вас также есть возможность сбросить только определенную коллекцию (и) или сбросить все, кроме определенной (их) коллекции.
Если вы хотите сбросить только одну коллекцию (например, пользователей):
mongodump --db database_name --collection users
Если вы хотите сбросить всю коллекцию, кроме пользователей:
mongodump --db database_name --excludeCollection=users
Также возможно вывести дамп в файл архива:
mongodump --archive=test.archive --db database_name