У вас есть ссылка на ваш модуль в основном приложении?Что-то связывает его с основным приложением, в противном случае оно не будет включено.
Проверьте отчет о ссылках из основного приложения, чтобы увидеть, где извлекается зависимость.
В FB3 шага:
Открыть свойства для проекта
Вкладка Flex Compiler
Добавить -link-report = true к дополнительным аргументам компилятора.
Сборка приложения.
Проверка отчета о связях.1.2.3.4.1.1.
Редактирование из комментариев.
Запуск отчета о связях для вашего модуляи уменьшите его до чисто зависимостей, которые вы хотите исключить.
Теперь добавьте следующую строку в дополнительные аргументы компилятора для вашего основного приложения
-load-externs = report.xml
где report - это отчет об урезанной ссылке.
Это предотвратит связывание зависимости в вашем основном приложении.