Это хорошо после ОП, но на всякий случай:
pydot . Позволяет генерировать и визуализировать графики. Если вам нужны графовые алгоритмы (транзитивное замыкание и т. Д.), Посмотрите также на pygraphlib, который расширяет и интегрирует pydot.
Обратите внимание, что ни один из них не позволяет интерактивно редактировать визуализированную диаграмму. Они оба используют graphviz для генерации вывода.