Как уже заметил @jonasr, проблема связана со стандартным режимом и некоторыми используемыми панелями.
Поскольку вы объявили <!DOCTYPE html>
в своем HTML-документе, браузер переведен в стандартный режим.
Как объясняет ссылка: некоторые «старые» панели (старые, как в GWT 2.0), в вашем случае VerticalPanel, не отображаются должным образом в стандартном режиме. Вместо этого вы должны использовать FlowPanel.
О добавлении стилей в IE - поскольку GWT выдает разные выходные данные для разных браузеров (работает с ошибками и причудами браузера), вполне возможно, что упомянутый вами стиль был добавлен GWT.