Если вы работаете в linux, из самой верхней директории, которая у вас есть в svn, запустите эту команду:
svn status
Любые файлы, которые появляются как имеющие? Символ рядом с ними не находится под контролем версии. Вы можете добавить их с помощью 'svn add '
Передайте их в свой репозиторий как обычно с помощью SVN commit.