Метод привязки данных <% # не будет работать напрямую внутри тегов <link>в теге :
<head runat="server">
<link rel="stylesheet" type="text/css"
href="css/style.css?v=<%# My.Constants.CSS_VERSION %>" />
</head>
Приведенный выше код оценивается как
<head>
<link rel="stylesheet" type="text/css"
href="css/style.css?v=<%# My.Constants.CSS_VERSION %>" />
</head>
Вместо этого вы должны сделать следующее (обратите внимание на две двойные кавычки внутри):
<head runat="server">
<link rel="stylesheet" type="text/css"
href="css/style.css?v=<%# "" + My.Constants.CSS_VERSION %>" />
</head>
И вы получите желаемый результат:
<head>
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/style.css?v=1.5" />
</head>