У меня немного другая ситуация, когда мое затмение перестает отвечать, и мне пришлось убить сеанс. После перезапуска Juno конкретный проект, над которым я работал, исчез, хотя файл .project существует. Попытка импорта обратно в Eclipse приведет к тому же «Некоторые проекты не могут быть импортированы ...» или «Проект с таким именем уже существует» при попытке создать новый проект.
В конце концов, поскольку я использовал рабочие наборы, мне удалось найти этот файл .metadata.plugins \ org.eclipse.ui.workbench \ workingsets.xml. Вручную добавил недостающую запись и перезапустил затмение и вуаля, оно вернулось.