Я думаю, вы должны добавить дополнительный контроль к этому:
var disableRes = false;
var refreshWindow = function() {
disableRes = false;
location.reload();
}
var resizeTimer;
if (disableRes == false) {
jQuery(window).resize(function() {
disableRes = true;
clearTimeout(resizeTimer);
resizeTimer = setTimeout(refreshWindow, 1000);
});
}