VS это только IDE. Вы можете использовать его для сборки со старым набором инструментов, но это требует некоторой настройки - вам нужно установить две параллельные установки VS (например, VS2008 + vs6) и загрузить с различными VSARGS. Смотрите этот превосходный шаг за шагом от Боян Ресник.
Обратите внимание, что в VS2010 это решение не применимо - оно имеет новые настройки для каждого проекта -> общие -> "набор инструментов платформы".
При желании установите этот и вручную обновите настройки проекта-> каталоги VC ++ (или вручную измените настройки по умолчанию ).