Хорошо решение найдено. Очевидно, я не выглядел достаточно усердно, это командная строка для установки пользовательских заголовков HTTP:
cscript adsutil.vbs set w3svc/HttpCustomHeaders "X-Powered-By: ASP.NET" "HeaderName2: value" "HeaderName3: value"
это нужно запустить из папки c: \ Inetpub \ AdminScripts.
В качестве бонуса, вот команда nant, чтобы сделать это в сценарии сборки:
<exec workingdir="c:\Inetpub\AdminScripts" program="cscript.exe" commandline="adsutil.vbs set W3SVC/1/ROOT/Insurance/HttpCustomHeaders "X-Powered-By: ASP.NET" "HeaderName2: value" "HeaderName3: value"" />
через Устранение неполадок, администрирование и концепции IIS .