Пример Numpy C-Api дает SegFault - PullRequest
Новая
       31

Пример Numpy C-Api дает SegFault

8 голосов
/ 11 октября 2011

Я пытаюсь понять, как работает Python C-Api, и я хочу обмениваться пустыми массивами между Python и расширением C.

Итак, я начал этот урок: http://dsnra.jpl.nasa.gov/software/Python/numpydoc/numpy-13.html

Попытка сделать первый пример там, модуль C, который вычисляет трассировку двумерного массива, был для меня очень аккуратным, так как я хочу выполнять элементарные операции и в двумерных массивах. 

#include <Python.h>
#include "Numeric/arrayobject.h"
#include<stdio.h>

int main(){
Py_Initialize();
import_array();
}

static char doc[] =
"This is the C extension for xor_masking routine";

    static PyObject *
    trace(PyObject *self, PyObject *args)
    {
    PyObject *input;
    PyArrayObject *array;
    double sum;
    int i, n;

    if (!PyArg_ParseTuple(args, "O", &input))
    return NULL;
    array = (PyArrayObject *)
    PyArray_ContiguousFromObject(input, PyArray_DOUBLE, 2, 2);
    if (array == NULL)
    return NULL;

    n = array->dimensions[0];
    if (n > array->dimensions[1])
    n = array->dimensions[1];
    sum = 0.;
    for (i = 0; i < n; i++)
    sum += *(double *)(array->data + i*array->strides[0] + i*array->strides[1]);
    Py_DECREF(array);
    return PyFloat_FromDouble(sum);
    }

static PyMethodDef TraceMethods[] = {
    {"trace", trace, METH_VARARGS, doc},
    {NULL, NULL, 0, NULL}
};

PyMODINIT_FUNC
inittrace(void)
{
    (void) Py_InitModule("trace", TraceMethods);
}


}

Имя модуля - trace, и он скомпилирован с файлом setup.py: 

from distutils.core import setup, Extension

module = Extension('trace', sources = ['xor_masking.cpp'])
setup(name = 'Trace Test', version = '1.0', ext_modules = [module])

Файл скомпилирован, trace.so импортирован в IPython, но когда я пытаюсь использовать метод trace (), У меня ошибка сегментации, я не знаю почему.

Я запускаю это с Fedora 15, Python 2.7.1, gcc 4.3.0, Numpy 1.5.1

1 Ответ

15 голосов
/ 12 октября 2011

Ваша функция инициализации модуля должна вызывать 

import_array();

после 

(void) Py_InitModule("trace", TraceMethods);

Это упоминается в уроке вверху, но его легко пропустить Без этого он segfaults на PyArray_ContiguousFromObject.

...