Это единственное решение реестра Cygwin64, которое работало для меня в Windows 8.1:
Windows Registry Editor Version 5.00
[HKEY_CLASSES_ROOT\Directory\shell\mintty]
@="Mintty from Here"
"NoWorkingDirectory"=""
[HKEY_CLASSES_ROOT\Directory\shell\mintty\command]
@="C:\\cygwin64\\bin\\mintty.exe -h always -e /usr/bin/ash -c 'cd \"$(/usr/bin/cygpath \"%L\")\"; exec /usr/bin/bash '"
Убедитесь, что вы изменили путь к C: \ cygwin64 по мере необходимости.