Как недавно узнала моя компания, AES - это не совсем Рейндаэль. AES имеет ограничение, согласно которому ключи ДОЛЖНЫ быть 128, 192 или 256-битными, однако Rijndael также допускает использование ключей с 160 и 224.
Как указано выше erickson, BouncyCastle предоставляет объект Rijndael, который поддерживает дополнительные длины ключей: 128/160/192/224/256 бит. В частности, взгляните на облегченный API.
Gnu-crypto - еще одна библиотека с открытым исходным кодом, однако она также НЕ обеспечивает поддержку 160- и 224-битных ключей.
Итак, если вы специально ищете полную поддержку Rijndael, то BouncyCastle - единственный, кого я нашел до сих пор.