на одном лайнере удалить все коллекции из базы данных mongo
примечание должно использовать --host, (-h - справка для команды mongo), а -d не является опцией, выберите команду db и после пароля.
mongo --host <mongo_host>:<mongo_port> -u <db_user> -p <db_pass> <your_db> --eval "db.dropDatabase()"