Я не думаю, что это возможно сделать на стороне сервера напрямую с LINQ to SQL. Однако существует решение на стороне клиента:
var result = new DataContext().Table.AsEnumerable()
.Select((x, i) => new { Index = i, Item = x })
.Where(t => t.Index % 5 == 0).Select(t => t.Item);