Я только что столкнулся с этой проблемой, и она, кажется, была вызвана тем, что не добавил пользовательское сообщение о фиксации над сообщением о фиксации по умолчанию (я подумал, зачем писать «начальная фиксация», когда ясно то же самое в сгенерированном Git тексте под ним).
Проблема была решена, когда я удалил каталог .git, повторно инициализировал каталог проекта для Git, повторно добавил удаленный GitHub, добавил все файлы на новый этап, зафиксировав личное сообщение над автоматически сгенерированным сообщением, и подтолкнул к оригиналу / мастеру.