Я думаю, что в IDA раньше была возможность сделать это, но ее нет в текущих версиях.
Вы должны просто использовать шестнадцатеричный редактор. Обратите внимание на смещение файла в IDA и отредактируйте файл по этому адресу. Если вы хотите увидеть изменения в IDA, используйте пункт меню «Файл» -> «Загрузить файл» -> «Перезагрузить файл ввода».