Мне удалось получить хороший результат в следующей последовательности (дважды запустить Matlab в начале):
h = gcf; % Current figure handle
set(h,'Resize','off');
set(h,'PaperPositionMode','manual');
set(h,'PaperPosition',[0 0 9 6]);
set(h,'PaperUnits','centimeters');
set(h,'PaperSize',[9 6]); % IEEE columnwidth = 9cm
set(h,'Position',[0 0 9 6]);
% xpos, ypos must be set
txlabel = text(xpos,ypos,'$$[\mathrm{min}]$$','Interpreter','latex','FontSize',9);
% Dump colored encapsulated PostScript
print('-depsc2','-loose', 'signals');