Это потому, что вы смешиваете два синтаксиса вместе.
Если у вас всегда есть именно эти три значения, вы можете просто И результаты трех выражений LIKE.
SELECT
*
FROM
Table1
WHERE
EmpPU NOT LIKE '%CSE%'
AND EmpPU NOT LIKE '%ECE%'
AND EmpPU NOT LIKE '%EEE%'
Если вынужно сделать это для «любого числа» значений, вы можете поместить значения в таблицу и выполнить объединение.
WITH
myData
AS
(
SELECT '%CSE%' AS match
UNION ALL SELECT '%ECE%' AS match
UNION ALL SELECT '%EEE%' AS match
)
SELECT
*
FROM
Table1
LEFT JOIN
myData
ON Table1.EmpPU LIKE myData.match
WHERE
myData.match IS NULL
ИЛИ ...
WITH
myData
AS
(
SELECT '%CSE%' AS match
UNION ALL SELECT '%ECE%' AS match
UNION ALL SELECT '%EEE%' AS match
)
SELECT
*
FROM
Table1
WHERE
NOT EXISTS (SELECT * FROM myData WHERE Table1.EmpPU LIKE match)