Ну, вы можете просто развернуть одно и то же веб-приложение MVC (или любое другое) в отдельных виртуальных каталогах, каждый со своей конфигурацией (и файлами CSS и т. Д.).
В качестве альтернативы вы можете изменить значение по умолчаниютаблицу маршрутов, чтобы включить {tenant} (как это часто называют) в качестве части пути, и добавить это в свои контроллеры.