Как установить цвет фона для каждого графика в сетке фасетов, используя числовые значения - PullRequest
Новая
       36

Как установить цвет фона для каждого графика в сетке фасетов, используя числовые значения

1 голос
/ 03 июля 2019

Я хотел бы покрасить фон каждого отдельного графика, чтобы выделить корреляцию. Все дело в графике автокорреляционной матрицы нескольких временных рядов.

После этого я почти получил его, насколько вы можете легко понять из моего супер упрощенного примера: 

library(tidyverse)
set.seed(214)

n <- 1000
df <- tibble(v1 = runif(n), v2 = runif(n)*0.1 + v1, v3 = runif(n)*0.2 + v2, v4 = runif(n)*0.3 + v3, v5 = runif(n)*0.4 + v4, v6 = runif(n)*0.5 + v5)

C                   <- crossing(w1 = 1:length(df), w2 = 1:length(df))    # Alle Kombinationsmöglichkeiten
CM                  <- array(0, dim = c(length(df), length(df)))   #Correlation Matrix

FACET_LIST <- lapply(1:nrow(C), function(c) { # c <- 14   C[c,]
  tibble(a1 = unlist(df[, C$w1[c]], use.names = FALSE), 
         a2 = unlist(df[, C$w2[c]], use.names = FALSE), 
         name1 = names(df[, C$w1[c]]),
         name2 = names(df[, C$w2[c]])
  )
})

FACET <- do.call(rbind.data.frame, FACET_LIST)

FACET$name1 <- as_factor(FACET$name1)
FACET$name2 <- as_factor(FACET$name2)

for (i in seq_along(df)) {
  for (j in seq_along(df)) {
    CM[i,j] <- cor(df[i], df[j], use = "complete.obs")
  }
}

dat_text <- data.frame(
  name1 = rep(names(df), each = length(names(df))), 
  name2 = rep(names(df), length(names(df))), 
  R2 = paste(round(as.vector(CM) * 100, 1), "%")
)

p <- ggplot()
p <- p + geom_point(data=FACET, aes(a1, a2), size = 0.5)
p <- p + stat_smooth(data=FACET, aes(a1, a2), method = "lm")
p <- p + facet_grid(vars(name1), vars(name2)) + coord_fixed()
p <- p + geom_rect(data = dat_text, aes(fill = R2), xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = -Inf, ymax = Inf, alpha = 0.3)
p <- p + geom_text(data = dat_text, aes(x = 0.3, y = 1.2, label = R2))
p <- p + scale_fill_brewer(palette = "Greens")

p

Я ищу последнюю строчку для работы. Это всегда дает мне цвета по умолчанию.

РЕДАКТИРОВАТЬ:

Код обновлен; У меня в основном сильные корреляции, но я бы хотел, чтобы цветовая шкала составляла от 0% до 100%. Вот как это выглядит сейчас: enter image description here

1 Ответ

0 голосов
/ 04 июля 2019

Итак, с вашей помощью я нашел решение. Во-первых, столбец dat_text$R2 должен быть числовым по причине. Добавление знака% преобразует его в символ, который интерпретируется как дискретная шкала. 

dat_text <- tibble(
  name1 = rep(names(df), each = length(names(df))), 
  name2 = rep(names(df), length(names(df))), 
  R2 = round(as.vector(CM) * 100, 1)
)

Знак процента можно добавить в вызове geom_text. Затем звонок scale_fill_gradient работает нормально тихо. Я не могу найти, чтобы исправить масштаб от 0% до 100%, но в конце это, вероятно, лучше. В противном случае между фоновыми цветами почти не будет различий. 

p <- ggplot()
p <- p + geom_point(data=FACET, aes(a1, a2), size = 0.5)
p <- p + stat_smooth(data=FACET, aes(a1, a2), method = "lm")
p <- p + facet_grid(vars(name1), vars(name2)) + coord_fixed()
p <- p + geom_rect(data = dat_text, aes(fill = R2), xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = -Inf, ymax = Inf, alpha = 0.3)
p <- p + geom_text(data = dat_text, aes(x = 0.3, y = 1.2, label = paste0(R2,"%")))
p <- p + scale_fill_gradient(low = "black", high = "darkgreen", aesthetics = "fill")
p

Вот так выглядит мой последний график: Maybe I will use stronger colors

...