Нет, вы не можете сделать это просто с помощью JS + PHP. При отправке формы браузер отправляет весь файл, но вы не можете указать, что он будет содержать только его части.
Однако вы можете делать то, что хотите, используя комбинацию Flash или Java + PHP, но вы должны переопределить подпрограмму загрузки, реализованную в PHP ...